1971-1973 гг. - работал в Государственной Третьяковской галерее.
В 1972 году поступил на подготовительные курсы в Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, где посещал лекции на искусствоведческом отделении исторического факультета.
В 1973 году поступил в Московский полиграфический институт (факультет редактирования печатных изданий), который закончил в 1978 году по специальности "Книговедение".
В 1974—1981 годы работал в Московском доме книги в должности заведующего отделом общественно-политической литературы.
С 1975 года работал в редакции "Журнала Московской Патриархии" под руководством архимандрита Иннокентия (Просвирнина).
В 1976 году женился, в этом же году родилась дочь Софья.
6 ноября 1979 году принял Святое Крещение, назван Николаем.
В июле 1981 году перешёл на постоянную работу в редакцию "Журнала Московской Патриархии", где до 1990 года работал в должности заведующего справочно-библиографическим отделом
В 1989 году экстерном закончил Московскую духовную семинарию.
25 февраля 1990 году епископом Можайским Григорием (Чирковым) рукоположен в сан диакона к храму Святой Троицы г. Люберцы
27 августа 1990 года епископом Можайским Григорием (Чирковым) рукоположен в священника
До 1992 года служил в Троицком храме г. Люберцы.
23 июля 1992 года назначен настоятелем Преображенского храма города Балашихи.
С 1997 года — член редакционной коллегии журнала "Московские епархиальные ведомости".
21 июля 1998 года назначен благочинным церквей Балашихинского округа Московской епархии.
В 1998—2004 годы — секретарь комиссии по издательской деятельности Московской епархии. 12 октября 2004 года назначен председателем отдела по издательской деятельности и связям со СМИ Московской епархии.
В 2000 году возведён в сан протоиерея.
В 2009 году награждён крестом с украшениями.
В 2009 году после умерла жена
31 марта 2011 года назначен пресс-секретарём Московской епархии.
28 сентября 2011 года в Крестовом храме Преображения Господня Новодевичьего монастыря города Москвы митрополитом Крутицким и Коломенским Ювеналием (Поярковым) пострижен в монашество с именем Николай в честь святого равноапостольного Николая, архиепископа Японского.
Решением Священного Синода от 5 октября 2011 года избран епископом Балашихинским, викарием Московской областной епархии
9 октября 2011 года в Лужецком Ферапонтовом Рождества Пресвятой Богородицы мужском монастыре митрополит Ювеналий (Поярков) возвёл иеромонаха Николая в сан архимандрита
3 декабря 2011 года состоялось наречение архимандрита Николая (Погребняка) во епископа Балашихинского
С 12 по 23 декабря 2011 года слушал двухнедельные курсы повышения квалификации для новоизбранных архиереев Русской Православной Церкви в Общецерковной аспирантуре и докторантуре имени святых равноапостольных Кирилла и Мефодия
1 января 2012 года за Божественной литургией в Храме Христа Спасителя Патриарх Кирилл возглавил хиротонию архимандрита Николая во епископа Балашихинского.
С 2013 г. - председатель Комиссии по культуре Московской епархии.
Почетный гражданин городского округа Балашиха (2012).
Награды Русской Православной Церкви:
Орден святого равноапостольного великого князя Владимира III ст. (1996)
Орден преподобного Сергия Радонежского III ст. (2000)
Орден святого благоверного князя Даниила Московского III ст. (2005)
медаль "1020-лет Крещения Руси" (2008)
Орден святителя Иннокентия, митрополита Московского и Коломенского III ст. (2008)