в 1975 году — окончил очную аспирантуру при кафедре патологической анатомии и в этом же году защитил кандидатскую диссертацию "Морфо-функциональные особенности синего пятна (электронно-микроскопическое исследование)". Затем работал ассистентом, старшим преподавателем, доцентом, а после защиты докторской диссертации "Морфо-функциональная харатеристика эндокринной системы почек при нефропатиях и вазоренальной гипертензии" в 1985 году — профессором кафедры патологической анатомии.
Ректор Московской Медицинской Академии имени И.М.Сеченова (ММА) с 1987 по 2009 гг. Избран на альтернативной основе в 1987 году, переизбран в 1992, 1997, 2002, 2007. В 2009 году был смещён с должности ректора ММА им. И. М. Сеченова в результате уголовного преследования за нерациональное использование бюджетных средств. Позднее, уголовное дело было закрыто из-за отсутствия состава преступления, однако М. А. Пальцев в должности ректора ММА им. И. М. Сеченова восстановлен не был. Вместо него ректором ММА (позднее Первый МГМУ) был назначен (а позднее формально избран) бывший ректор Саратовского ГМУ П. В. Глыбочко.
Умер 17 апреля 2025 г.
Академик Российской академии наук (РАН) и Российской академии медицинских наук (РАМН), доктор медицинских наук, профессор (по специальности "Патологическая анатомия").
Член Президиумов РАН и РАМН, первый вице-президент РАМН, заместитель академика-секретаря Отделения биологических наук и руководитель секции физиологии РАН, член Президиума ВАК Министерства образования и науки России. В качестве ректора председательствовал в Совете Ассоциации медицинских и фармацевтических вузов России.
Эксперт Всемирной организации здравохранения.
Главный редактор журналов "Архив паталогии", "Молекулярная медицина", "Российский медицинский форум", "Вестник медицинских конкурсов", член редколлегии журналов "Вестник РАМН", "Высшее образование в России", "Медицина и образование", "Фармацевтическая служба".
Является почетным членом Императорского Православного Палестинского Общества.